L'Institut d'Ecologie Appliquée est spécialisé dans l'ingénierie de l'environnement et de l'aménagement. L'IE&A de Saint Jean de Braye assure l'étude et la gestion des milieux naturels, la gestion de l'espace et l'aménagement du territoire, des études réglementaires, prodigue conseil et assistance, assure la concertation et la communication et enfin assure un important travail de recherche et développement.